01.民國37年9月，創立為台南縣斗六區饒平國民學校六合分校。
02.民國42年9月，獨立為雲林縣莿桐鄉六合國民學校，派江念華為首任校長。
03.民國46年9月，江念華校長卸任，張勝助接第2任校長。
04.民國51年9月，張勝助校長卸任，王亞夫接第3任校長。
05.民國57年9月，奉令改名為雲林縣莿桐鄉六合國民小學。
06.民國60年2月，王亞夫校長卸任，陳其星接任第4任校長。
07.民國67年9月，陳其星校長卸任，柳錦爐接第5任校長。
08.民國76年9月，柳錦爐校長卸任，嚴保江接第6任校長。
09.民國80年8月，嚴保江校長卸任，劉守恩接第7任校長。
10.民國82年12月1日，奉准開辦六合國民小學學校午餐工作。
11.民國85年8月，劉守恩校長卸任，洪淑女接任第8任校長。
12.民國93年8月，洪淑女校長卸任，張麗娟接任第9任校長。
13.民國100年8月，張麗娟校長卸任，林志郎接任第10任校長。
14.民國106年8月，林志郎校長卸任，李盈萩接任第11任校長。